Investigadores de la Universidad de Brown han creado un método automatizado que disminuye significativamente el tiempo necesario para preparar muestras bacterianas destinadas a la secuenciación genética. Este avance podría facilitar la participación de pequeños laboratorios en las redes de vigilancia de brotes de la FDA (Administración de Alimentos y Medicamentos) y los CDC (Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades) en Estados Unidos.
Automatización del proceso de preparación de muestras
El procedimiento, llamado Pathogen2Read, automatiza la lisis celular, extracción y preparación de librerías de ADN mediante un sistema que emplea una máquina de procesamiento de líquidos y un cóctel enzimático específico. Esta innovación reduce el tiempo de preparación manual de entre ocho y diez horas a aproximadamente 45 minutos, además de disminuir el tiempo de espera de 16 horas a solo media hora. La muestra se carga junto con los reactivos en una placa, y el sistema realiza automáticamente el resto del proceso en seis horas.
Impacto en la vigilancia epidemiológica
La tecnología de secuenciación de nueva generación permite identificar genomas completos de patógenos con rapidez, pero la preparación manual de muestras ha sido un cuello de botella en la rapidez de respuesta ante brotes. Pathogen2Read supera esta limitación, mejorando la capacidad para detectar mutaciones relevantes, como las relacionadas con la resistencia a fármacos, especialmente en bacterias grampositivas.
Colaboración y publicación
El desarrollo contó con la colaboración de investigadores de la FDA y el apoyo financiero de la empresa biotecnológica Revvity. Los resultados se han publicado en la revista BMC Genomics. Este método busca fortalecer la inclusión de laboratorios locales más pequeños en los sistemas de control de brotes, contribuyendo a una respuesta más ágil y eficaz ante enfermedades transmitidas por alimentos u otras fuentes.
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